Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD7Q8N8D1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD7Q8N8D1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCD7Q8N8D1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCD7Q8N8D1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCD7Q8N8D1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms