Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC103Q8IW40 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC103Q8IW40 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC103Q8IW40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms