Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC103Q8IW40 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CCDC103Q8IW40 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.49
CCDC103Q8IW40 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC103Q8IW40 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC103Q8IW40 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC103Q8IW40 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC103Q8IW40 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC103Q8IW40 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC103Q8IW40 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC103Q8IW40 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC103Q8IW40 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC103Q8IW40 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC103Q8IW40 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC103Q8IW40 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC103Q8IW40 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC103Q8IW40 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC103Q8IW40 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC103Q8IW40 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC103Q8IW40 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC103Q8IW40 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC103Q8IW40 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC103Q8IW40 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC103Q8IW40 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC103Q8IW40 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC103Q8IW40 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC103Q8IW40 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC103Q8IW40 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC103Q8IW40 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC103Q8IW40 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC103Q8IW40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC103Q8IW40 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC103Q8IW40 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC103Q8IW40 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC103Q8IW40 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC103Q8IW40 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC103Q8IW40 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC103Q8IW40 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC103Q8IW40 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC103Q8IW40 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC103Q8IW40 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC103Q8IW40 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC103Q8IW40 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC103Q8IW40 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC103Q8IW40 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC103Q8IW40 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC103Q8IW40 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC103Q8IW40 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC103Q8IW40 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC103Q8IW40 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC103Q8IW40 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC103Q8IW40 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC103Q8IW40 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC103Q8IW40 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC103Q8IW40 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC103Q8IW40 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC103Q8IW40 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC103Q8IW40 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC103Q8IW40 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC103Q8IW40 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC103Q8IW40 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC103Q8IW40 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC103Q8IW40 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC103Q8IW40 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC103Q8IW40 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC103Q8IW40 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC103Q8IW40 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC103Q8IW40 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC103Q8IW40 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC103Q8IW40 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC103Q8IW40 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC103Q8IW40 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC103Q8IW40 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC103Q8IW40 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC103Q8IW40 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC103Q8IW40 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC103Q8IW40 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC103Q8IW40 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC103Q8IW40 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC103Q8IW40 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC103Q8IW40 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC103Q8IW40 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC103Q8IW40 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC103Q8IW40 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC103Q8IW40 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC103Q8IW40 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC103Q8IW40 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC103Q8IW40 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC103Q8IW40 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC103Q8IW40 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC103Q8IW40 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC103Q8IW40 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC103Q8IW40 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC103Q8IW40 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC103Q8IW40 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC103Q8IW40 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC103Q8IW40 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC103Q8IW40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC103Q8IW40 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms