Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VSIG1Q86XK7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VSIG1Q86XK7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VSIG1Q86XK7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VSIG1Q86XK7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VSIG1Q86XK7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSIG1Q86XK7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms