Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA2D4Q7Z3S7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CACNA2D4Q7Z3S7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms