Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP77Q6ZQR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP77Q6ZQR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP77Q6ZQR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP77Q6ZQR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms