Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LETMD1Q6P1Q0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LETMD1Q6P1Q0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LETMD1Q6P1Q0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LETMD1Q6P1Q0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LETMD1Q6P1Q0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms