Protein–RNA interactions for Protein: Q68CK6

ACSM2B, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2BQ68CK6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSM2BQ68CK6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSM2BQ68CK6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSM2BQ68CK6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSM2BQ68CK6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms