Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCERG1LQ5VWI1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCERG1LQ5VWI1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCERG1LQ5VWI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TCERG1LQ5VWI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TCERG1LQ5VWI1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms