Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT6Q5T7P8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT6Q5T7P8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT6Q5T7P8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT6Q5T7P8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms