Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT6Q5T7P8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYT6Q5T7P8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYT6Q5T7P8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYT6Q5T7P8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYT6Q5T7P8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYT6Q5T7P8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYT6Q5T7P8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYT6Q5T7P8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYT6Q5T7P8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYT6Q5T7P8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYT6Q5T7P8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYT6Q5T7P8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYT6Q5T7P8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYT6Q5T7P8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SYT6Q5T7P8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYT6Q5T7P8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYT6Q5T7P8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT6Q5T7P8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYT6Q5T7P8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT6Q5T7P8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT6Q5T7P8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT6Q5T7P8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT6Q5T7P8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT6Q5T7P8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT6Q5T7P8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT6Q5T7P8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYT6Q5T7P8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT6Q5T7P8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT6Q5T7P8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT6Q5T7P8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT6Q5T7P8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYT6Q5T7P8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYT6Q5T7P8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYT6Q5T7P8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYT6Q5T7P8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYT6Q5T7P8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYT6Q5T7P8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYT6Q5T7P8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYT6Q5T7P8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT6Q5T7P8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT6Q5T7P8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYT6Q5T7P8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT6Q5T7P8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT6Q5T7P8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYT6Q5T7P8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYT6Q5T7P8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYT6Q5T7P8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYT6Q5T7P8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYT6Q5T7P8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYT6Q5T7P8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYT6Q5T7P8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYT6Q5T7P8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYT6Q5T7P8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYT6Q5T7P8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYT6Q5T7P8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYT6Q5T7P8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYT6Q5T7P8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYT6Q5T7P8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYT6Q5T7P8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYT6Q5T7P8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT6Q5T7P8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT6Q5T7P8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT6Q5T7P8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT6Q5T7P8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT6Q5T7P8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT6Q5T7P8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT6Q5T7P8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT6Q5T7P8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYT6Q5T7P8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYT6Q5T7P8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT6Q5T7P8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT6Q5T7P8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT6Q5T7P8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT6Q5T7P8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT6Q5T7P8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT6Q5T7P8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT6Q5T7P8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT6Q5T7P8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYT6Q5T7P8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYT6Q5T7P8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT6Q5T7P8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYT6Q5T7P8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT6Q5T7P8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT6Q5T7P8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT6Q5T7P8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms