Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C10orf55Q5SWW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C10orf55Q5SWW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C10orf55Q5SWW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C10orf55Q5SWW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms