Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HABP4Q5JVS0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HABP4Q5JVS0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HABP4Q5JVS0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HABP4Q5JVS0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HABP4Q5JVS0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms