Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGO1Q5FBB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGO1Q5FBB7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGO1Q5FBB7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGO1Q5FBB7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms