Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LONRF3Q496Y0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LONRF3Q496Y0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LONRF3Q496Y0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LONRF3Q496Y0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LONRF3Q496Y0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.9 ms