Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGS1Q32NB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGS1Q32NB8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGS1Q32NB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGS1Q32NB8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGS1Q32NB8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms