Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSR1Q2NL82 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSR1Q2NL82 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR1Q2NL82 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSR1Q2NL82 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSR1Q2NL82 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms