Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF4Q2M2E3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ODF4Q2M2E3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ODF4Q2M2E3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF4Q2M2E3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms