Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNN3Q15417 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNN3Q15417 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNN3Q15417 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNN3Q15417 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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