Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNB1Q14721 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KCNB1Q14721 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNB1Q14721 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNB1Q14721 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNB1Q14721 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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