Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 C14orf2-204ENST00000553449 271 ntTSL 28.73□□□□□ -1.016e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.026e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.076e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.086e-11■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 38.14□□□□□ -1.116e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-203ENST00000553430 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.116e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.116e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.126e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.146e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.216e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TRRAP-205ENST00000456197 11654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.226e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.246e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.256e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.266e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-213ENST00000438761 887 ntTSL 57.13□□□□□ -1.276e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.286e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 ZNFX1-201ENST00000371744 2964 ntTSL 27.03□□□□□ -1.286e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.286e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.36e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 RAC1-203ENST00000473564 576 ntTSL 26.84□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-206ENST00000554287 361 ntTSL 36.84□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CAPN2-209ENST00000487223 2991 ntTSL 26.84□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.326e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.326e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.346e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.386e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.386e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SUPT5H-209ENST00000596208 323 ntTSL 26.15□□□□□ -1.426e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 SPATS2L-224ENST00000468832 547 ntTSL 35.99□□□□□ -1.456e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.486e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CAPN2-206ENST00000474026 4130 ntTSL 24.59□□□□□ -1.686e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -26e-6■■■■□ 24.2
PUM1Q14671 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 MAPK12-204ENST00000467891 2019 ntTSL 528.31■■■□□ 2.123e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.653e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 315.24■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 24.1
PUM1Q14671 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-7■■■■□ 24
PUM1Q14671 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.451e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.411e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.012e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 TMED9-202ENST00000505521 925 ntTSL 220.13■□□□□ 0.811e-7■■■■□ 24
PUM1Q14671 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 24
PUM1Q14671 TMED9-204ENST00000507723 1018 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 24
PUM1Q14671 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 227.28■■□□□ 1.961e-6■■■■□ 24
PUM1Q14671 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.711e-6■■■■□ 24
PUM1Q14671 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.471e-6■■■■□ 24
PUM1Q14671 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 24
PUM1Q14671 MAP7D1-210ENST00000527764 945 ntTSL 220.39■□□□□ 0.852e-8■■■■□ 24
PUM1Q14671 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 219.78■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 24
PUM1Q14671 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-7■■■■□ 23.9
PUM1Q14671 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 23.9
PUM1Q14671 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 210.53□□□□□ -0.725e-7■■■■□ 23.9
PUM1Q14671 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 23.9
PUM1Q14671 KDM3A-210ENST00000470160 2955 ntTSL 26.59□□□□□ -1.355e-7■■■■□ 23.9
PUM1Q14671 KDM3A-214ENST00000491383 4485 ntTSL 1 (best)4.88□□□□□ -1.635e-7■■■■□ 23.9
PUM1Q14671 UBN1-209ENST00000592120 2305 ntTSL 219.42■□□□□ 0.78e-9■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 PPP1CC-211ENST00000620030 582 ntTSL 224.8■■□□□ 1.569e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CWC15-203ENST00000542165 921 ntTSL 1 (best)21.24■□□□□ 0.999e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.929e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.899e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.79e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ZCCHC11-210ENST00000473856 2047 ntTSL 1 (best)19.1■□□□□ 0.659e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-209ENST00000565255 754 ntTSL 318.18■□□□□ 0.59e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.399e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 CWC15-204ENST00000542907 790 ntTSL 317.33■□□□□ 0.369e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-202ENST00000366090 734 ntTSL 317.3■□□□□ 0.369e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ECT2-207ENST00000426894 560 ntTSL 417.3■□□□□ 0.369e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RDX-214ENST00000533678 531 ntTSL 417.02■□□□□ 0.329e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-208ENST00000564920 562 ntTSL 516.91■□□□□ 0.39e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.189e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 RDX-216ENST00000533991 544 ntTSL 415.76■□□□□ 0.119e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-214ENST00000557437 575 ntTSL 415.68■□□□□ 0.19e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 ZCCHC11-214ENST00000484723 2910 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.089e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 315.48■□□□□ 0.079e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 FANCI-213ENST00000567891 584 ntTSL 315.35■□□□□ 0.059e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.029e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.019e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 SEC23A-212ENST00000556092 571 ntTSL 415.04■□□□□ -09e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.059e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.069e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.139e-6■■■■□ 23.7
PUM1Q14671 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 314.13□□□□□ -0.159e-6■■■■□ 23.7
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