RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488719.1

PES1-212, Transcript of pescadillo ribosomal biogenesis factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene PES1, Length 1,732 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1-212ENST00000488719 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.08■■■■■ 4.49
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PES1-212ENST00000488719 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.63■■■■□ 3.29
PES1-212ENST00000488719 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.45■■■■□ 3.26
PES1-212ENST00000488719 NACADO15069 1562 aa35.4■■■■□ 3.26
PES1-212ENST00000488719 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.22■■■■□ 3.23
PES1-212ENST00000488719 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.7■■■■□ 3.15
PES1-212ENST00000488719 SCRIBQ14160 1630 aa34.69■■■■□ 3.14
PES1-212ENST00000488719 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.43■■■■□ 3.1
PES1-212ENST00000488719 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.16■■■■□ 3.06
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PES1-212ENST00000488719 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.52■■■□□ 2.96
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PES1-212ENST00000488719 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.24■■■□□ 2.91
PES1-212ENST00000488719 SMARCA4P51532 1647 aa33.22■■■□□ 2.91
PES1-212ENST00000488719 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
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PES1-212ENST00000488719 WIZO95785 1651 aa32.92■■■□□ 2.86
PES1-212ENST00000488719 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.86■■■□□ 2.85
PES1-212ENST00000488719 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.86■■■□□ 2.85
PES1-212ENST00000488719 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.84■■■□□ 2.85
PES1-212ENST00000488719 SMARCA2P51531 1590 aa32.81■■■□□ 2.84
PES1-212ENST00000488719 NCAPD3P42695 1498 aa32.69■■■□□ 2.82
PES1-212ENST00000488719 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
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PES1-212ENST00000488719 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
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PES1-212ENST00000488719 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.82■■■□□ 2.68
PES1-212ENST00000488719 CFTRP13569 1480 aa31.79■■■□□ 2.68
PES1-212ENST00000488719 NESP48681 1621 aa31.69■■■□□ 2.66
PES1-212ENST00000488719 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.65■■■□□ 2.66
PES1-212ENST00000488719 PRDM2Q13029 1718 aa31.51■■■□□ 2.64
PES1-212ENST00000488719 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.45■■■□□ 2.62
PES1-212ENST00000488719 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.43■■■□□ 2.62
PES1-212ENST00000488719 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.38■■■□□ 2.61
PES1-212ENST00000488719 ABCC8Q09428 1581 aa31.35■■■□□ 2.61
PES1-212ENST00000488719 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.29■■■□□ 2.6
PES1-212ENST00000488719 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.27■■■□□ 2.6
PES1-212ENST00000488719 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.59
PES1-212ENST00000488719 ERCC6Q03468 1493 aa31.2■■■□□ 2.59
PES1-212ENST00000488719 TRIM41Q8WV44 630 aa31.19■■■□□ 2.58
PES1-212ENST00000488719 CUX1P39880 1505 aa31.13■■■□□ 2.57
PES1-212ENST00000488719 SYNJ1O43426 1573 aa31.13■■■□□ 2.57
PES1-212ENST00000488719 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
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PES1-212ENST00000488719 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.03■■■□□ 2.56
PES1-212ENST00000488719 TOPBP1Q92547 1522 aa31.03■■■□□ 2.56
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PES1-212ENST00000488719 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.58■■■□□ 2.49
PES1-212ENST00000488719 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PES1-212ENST00000488719 KIF27Q86VH2 1401 aa30.53■■■□□ 2.48
PES1-212ENST00000488719 WDR97A6NE52 1622 aa30.52■■■□□ 2.48
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PES1-212ENST00000488719 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
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PES1-212ENST00000488719 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.24■■■□□ 2.43
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PES1-212ENST00000488719 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.17■■■□□ 2.42
PES1-212ENST00000488719 PRXQ9BXM0 1461 aa30.17■■■□□ 2.42
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PES1-212ENST00000488719 SYNJ2O15056 1496 aa29.94■■■□□ 2.38
PES1-212ENST00000488719 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PES1-212ENST00000488719 FBLN2P98095 1184 aa29.91■■■□□ 2.38
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PES1-212ENST00000488719 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.84■■■□□ 2.37
PES1-212ENST00000488719 CHD1O14646 1710 aa29.74■■■□□ 2.35
PES1-212ENST00000488719 NUP160Q12769 1436 aa29.69■■■□□ 2.34
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