RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.31■■■■■ 6.92
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.97■■■■■ 5.91
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCC9O60706 1549 aa51.63■■■■■ 5.86
PPP1CC-211ENST00000620030 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.3■■■■■ 5.48
PPP1CC-211ENST00000620030 NACADO15069 1562 aa49.12■■■■■ 5.45
PPP1CC-211ENST00000620030 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.07■■■■■ 5.45
PPP1CC-211ENST00000620030 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.65■■■■■ 5.38
PPP1CC-211ENST00000620030 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
PPP1CC-211ENST00000620030 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.24■■■■■ 5.31
PPP1CC-211ENST00000620030 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.19■■■■■ 5.31
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.17■■■■■ 5.3
PPP1CC-211ENST00000620030 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.1■■■■■ 5.29
PPP1CC-211ENST00000620030 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.9■■■■■ 5.26
PPP1CC-211ENST00000620030 SCRIBQ14160 1630 aa47.41■■■■■ 5.18
PPP1CC-211ENST00000620030 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.27■■■■■ 5.16
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.65■■■■■ 5.06
PPP1CC-211ENST00000620030 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.62■■■■■ 5.05
PPP1CC-211ENST00000620030 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.47■■■■■ 5.03
PPP1CC-211ENST00000620030 NCAPD3P42695 1498 aa45.42■■■■■ 4.86
PPP1CC-211ENST00000620030 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.32■■■■■ 4.85
PPP1CC-211ENST00000620030 SMARCA4P51532 1647 aa45.3■■■■■ 4.84
PPP1CC-211ENST00000620030 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
PPP1CC-211ENST00000620030 SMARCA2P51531 1590 aa45.16■■■■■ 4.82
PPP1CC-211ENST00000620030 HMGXB3Q12766 1538 aa45.02■■■■■ 4.8
PPP1CC-211ENST00000620030 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.94■■■■■ 4.78
PPP1CC-211ENST00000620030 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.91■■■■■ 4.78
PPP1CC-211ENST00000620030 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
PPP1CC-211ENST00000620030 NESP48681 1621 aa44.5■■■■■ 4.71
PPP1CC-211ENST00000620030 ERCC6Q03468 1493 aa44.5■■■■■ 4.71
PPP1CC-211ENST00000620030 WIZO95785 1651 aa44.35■■■■■ 4.69
PPP1CC-211ENST00000620030 CUX2O14529 1486 aa44.29■■■■■ 4.68
PPP1CC-211ENST00000620030 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
PPP1CC-211ENST00000620030 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.22■■■■■ 4.67
PPP1CC-211ENST00000620030 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.07■■■■■ 4.65
PPP1CC-211ENST00000620030 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.01■■■■■ 4.64
PPP1CC-211ENST00000620030 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
PPP1CC-211ENST00000620030 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.86■■■■■ 4.61
PPP1CC-211ENST00000620030 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.81■■■■■ 4.6
PPP1CC-211ENST00000620030 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
PPP1CC-211ENST00000620030 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.57■■■■■ 4.56
PPP1CC-211ENST00000620030 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.47■■■■■ 4.55
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.42■■■■■ 4.54
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR62O43379 1518 aa43.42■■■■■ 4.54
PPP1CC-211ENST00000620030 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
PPP1CC-211ENST00000620030 PRDM2Q13029 1718 aa43.02■■■■■ 4.48
PPP1CC-211ENST00000620030 TOPBP1Q92547 1522 aa42.73■■■■■ 4.43
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCC8Q09428 1581 aa42.69■■■■■ 4.42
PPP1CC-211ENST00000620030 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
PPP1CC-211ENST00000620030 IFT140Q96RY7 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
PPP1CC-211ENST00000620030 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.57■■■■■ 4.41
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
PPP1CC-211ENST00000620030 OSCARQ8IYS5 282 aa42.46■■■■■ 4.39
PPP1CC-211ENST00000620030 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
PPP1CC-211ENST00000620030 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
PPP1CC-211ENST00000620030 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.354e-8■■■■■ 43
PPP1CC-211ENST00000620030 SOGA1O94964 1423 aa42.2■■■■■ 4.35
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
PPP1CC-211ENST00000620030 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.19■■■■■ 4.34
PPP1CC-211ENST00000620030 CUX1P39880 1505 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP1CC-211ENST00000620030 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.12■■■■■ 4.33
PPP1CC-211ENST00000620030 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM41Q8WV44 630 aa42.05■■■■■ 4.32
PPP1CC-211ENST00000620030 WDR97A6NE52 1622 aa41.85■■■■■ 4.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FBLN2P98095 1184 aa41.85■■■■■ 4.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CHD1O14646 1710 aa41.76■■■■■ 4.28
PPP1CC-211ENST00000620030 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.74■■■■■ 4.27
PPP1CC-211ENST00000620030 GRIN2BQ13224 1484 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.27
PPP1CC-211ENST00000620030 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.69■■■■■ 4.27
PPP1CC-211ENST00000620030 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.69■■■■■ 4.27
PPP1CC-211ENST00000620030 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.69■■■■■ 4.27
PPP1CC-211ENST00000620030 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
PPP1CC-211ENST00000620030 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
PPP1CC-211ENST00000620030 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGEF11O15085 1522 aa41.65■■■■■ 4.26
PPP1CC-211ENST00000620030 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
PPP1CC-211ENST00000620030 TOP2BQ02880 1626 aa41.58■■■■■ 4.25
PPP1CC-211ENST00000620030 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SYNJ1O43426 1573 aa41.54■■■■■ 4.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SYNJ2O15056 1496 aa41.53■■■■■ 4.24
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.51■■■■■ 4.24
PPP1CC-211ENST00000620030 PBRM1Q86U86 1689 aa41.45■■■■■ 4.23
PPP1CC-211ENST00000620030 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.42■■■■■ 4.22
PPP1CC-211ENST00000620030 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.39■■■■■ 4.22
PPP1CC-211ENST00000620030 ARAP1Q96P48 1450 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP1CC-211ENST00000620030 GRIN2AQ12879 1464 aa41.18■■■■■ 4.18
PPP1CC-211ENST00000620030 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.17■■■■■ 4.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ADAMTS12P58397 1594 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP1CC-211ENST00000620030 NUP160Q12769 1436 aa41.06■■■■■ 4.16
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP170Q5SW79 1584 aa40.99■■■■■ 4.15
PPP1CC-211ENST00000620030 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF27Q86VH2 1401 aa40.84■■■■■ 4.13
PPP1CC-211ENST00000620030 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.8■■■■■ 4.12
PPP1CC-211ENST00000620030 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
PPP1CC-211ENST00000620030 SHROOM2Q13796 1616 aa40.75■■■■■ 4.11
PPP1CC-211ENST00000620030 JPH4Q96JJ6 628 aa40.73■■■■■ 4.11
PPP1CC-211ENST00000620030 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
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