Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XRCC4Q13426 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
XRCC4Q13426 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XRCC4Q13426 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XRCC4Q13426 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
XRCC4Q13426 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
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