Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSTF3Q12996 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSTF3Q12996 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSTF3Q12996 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSTF3Q12996 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSTF3Q12996 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
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