Protein–RNA interactions for Protein: Q12882

DPYD, Dihydropyrimidine dehydrogenase [NADP(+)], humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYDQ12882 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DPYDQ12882 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DPYDQ12882 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPYDQ12882 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DPYDQ12882 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DPYDQ12882 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DPYDQ12882 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DPYDQ12882 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DPYDQ12882 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPYDQ12882 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPYDQ12882 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DPYDQ12882 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DPYDQ12882 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms