Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBQ06643 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBQ06643 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBQ06643 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBQ06643 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBQ06643 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBQ06643 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBQ06643 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBQ06643 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBQ06643 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBQ06643 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBQ06643 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBQ06643 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBQ06643 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBQ06643 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBQ06643 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBQ06643 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTBQ06643 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBQ06643 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBQ06643 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBQ06643 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBQ06643 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBQ06643 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTBQ06643 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTBQ06643 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTBQ06643 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBQ06643 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBQ06643 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTBQ06643 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBQ06643 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBQ06643 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBQ06643 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTBQ06643 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBQ06643 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBQ06643 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTBQ06643 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBQ06643 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBQ06643 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBQ06643 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBQ06643 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBQ06643 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBQ06643 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBQ06643 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBQ06643 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBQ06643 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBQ06643 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBQ06643 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBQ06643 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBQ06643 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBQ06643 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBQ06643 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBQ06643 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBQ06643 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBQ06643 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBQ06643 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBQ06643 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBQ06643 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBQ06643 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBQ06643 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LTBQ06643 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBQ06643 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBQ06643 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBQ06643 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBQ06643 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LTBQ06643 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LTBQ06643 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBQ06643 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LTBQ06643 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBQ06643 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBQ06643 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBQ06643 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBQ06643 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBQ06643 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LTBQ06643 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms