Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LTBQ06643 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LTBQ06643 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBQ06643 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTBQ06643 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LTBQ06643 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBQ06643 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTBQ06643 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LTBQ06643 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTBQ06643 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LTBQ06643 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LTBQ06643 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBQ06643 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LTBQ06643 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LTBQ06643 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LTBQ06643 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBQ06643 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBQ06643 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBQ06643 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBQ06643 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBQ06643 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBQ06643 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBQ06643 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBQ06643 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LTBQ06643 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LTBQ06643 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LTBQ06643 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LTBQ06643 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBQ06643 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LTBQ06643 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBQ06643 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBQ06643 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBQ06643 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBQ06643 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBQ06643 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTBQ06643 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTBQ06643 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBQ06643 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LTBQ06643 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LTBQ06643 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LTBQ06643 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LTBQ06643 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LTBQ06643 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LTBQ06643 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LTBQ06643 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LTBQ06643 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LTBQ06643 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTBQ06643 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LTBQ06643 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTBQ06643 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTBQ06643 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LTBQ06643 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBQ06643 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBQ06643 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBQ06643 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBQ06643 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBQ06643 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBQ06643 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBQ06643 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTBQ06643 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBQ06643 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTBQ06643 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTBQ06643 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LTBQ06643 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBQ06643 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LTBQ06643 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBQ06643 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBQ06643 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LTBQ06643 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LTBQ06643 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LTBQ06643 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTBQ06643 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTBQ06643 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBQ06643 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBQ06643 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBQ06643 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBQ06643 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LTBQ06643 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LTBQ06643 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LTBQ06643 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBQ06643 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBQ06643 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBQ06643 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTBQ06643 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBQ06643 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBQ06643 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBQ06643 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBQ06643 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBQ06643 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBQ06643 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBQ06643 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBQ06643 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LTBQ06643 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBQ06643 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LTBQ06643 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LTBQ06643 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBQ06643 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LTBQ06643 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBQ06643 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LTBQ06643 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms