Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GABPB1Q06547 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GABPB1Q06547 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABPB1Q06547 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GABPB1Q06547 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABPB1Q06547 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms