Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRSF11Q05519 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRSF11Q05519 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF11Q05519 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SRSF11Q05519 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF11Q05519 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms