Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGCS1Q01581 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGCS1Q01581 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HMGCS1Q01581 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGCS1Q01581 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms