Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFKB2Q00653 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFKB2Q00653 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NFKB2Q00653 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFKB2Q00653 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKB2Q00653 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms