Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK17Q00537 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK17Q00537 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDK17Q00537 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDK17Q00537 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDK17Q00537 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms