Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GNB1P62873 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GNB1P62873 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB1P62873 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB1P62873 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNB1P62873 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB1P62873 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB1P62873 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB1P62873 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNB1P62873 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB1P62873 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB1P62873 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB1P62873 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB1P62873 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB1P62873 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNB1P62873 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB1P62873 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB1P62873 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB1P62873 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNB1P62873 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNB1P62873 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB1P62873 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB1P62873 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB1P62873 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB1P62873 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB1P62873 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GNB1P62873 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB1P62873 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB1P62873 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB1P62873 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB1P62873 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB1P62873 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GNB1P62873 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB1P62873 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB1P62873 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB1P62873 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GNB1P62873 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB1P62873 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB1P62873 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GNB1P62873 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB1P62873 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB1P62873 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GNB1P62873 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB1P62873 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB1P62873 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB1P62873 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB1P62873 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GNB1P62873 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB1P62873 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB1P62873 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB1P62873 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GNB1P62873 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GNB1P62873 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GNB1P62873 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GNB1P62873 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms