Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS4XP62701 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS4XP62701 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS4XP62701 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS4XP62701 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms