Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMA6P60900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMA6P60900 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA6P60900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA6P60900 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA6P60900 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms