Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK2P51955 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK2P51955 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK2P51955 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK2P51955 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK2P51955 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK2P51955 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK2P51955 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK2P51955 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEK2P51955 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK2P51955 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEK2P51955 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK2P51955 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK2P51955 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK2P51955 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK2P51955 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK2P51955 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK2P51955 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK2P51955 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK2P51955 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK2P51955 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK2P51955 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK2P51955 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK2P51955 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK2P51955 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK2P51955 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK2P51955 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK2P51955 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK2P51955 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK2P51955 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK2P51955 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK2P51955 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK2P51955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK2P51955 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK2P51955 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK2P51955 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK2P51955 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK2P51955 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK2P51955 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK2P51955 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK2P51955 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK2P51955 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK2P51955 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK2P51955 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK2P51955 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK2P51955 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK2P51955 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK2P51955 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK2P51955 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK2P51955 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK2P51955 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK2P51955 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK2P51955 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK2P51955 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK2P51955 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK2P51955 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK2P51955 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK2P51955 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK2P51955 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK2P51955 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK2P51955 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK2P51955 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK2P51955 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK2P51955 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK2P51955 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK2P51955 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK2P51955 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK2P51955 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK2P51955 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK2P51955 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms