Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNHP51946 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNHP51946 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNHP51946 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNHP51946 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNHP51946 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNHP51946 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNHP51946 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNHP51946 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNHP51946 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNHP51946 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNHP51946 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNHP51946 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNHP51946 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNHP51946 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNHP51946 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNHP51946 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNHP51946 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNHP51946 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNHP51946 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNHP51946 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNHP51946 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNHP51946 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNHP51946 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNHP51946 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNHP51946 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNHP51946 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNHP51946 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNHP51946 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNHP51946 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNHP51946 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNHP51946 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNHP51946 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNHP51946 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNHP51946 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNHP51946 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNHP51946 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNHP51946 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNHP51946 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNHP51946 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNHP51946 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNHP51946 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNHP51946 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNHP51946 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNHP51946 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNHP51946 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNHP51946 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNHP51946 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNHP51946 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNHP51946 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNHP51946 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNHP51946 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNHP51946 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNHP51946 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNHP51946 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNHP51946 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNHP51946 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNHP51946 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNHP51946 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNHP51946 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNHP51946 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNHP51946 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNHP51946 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNHP51946 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNHP51946 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNHP51946 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNHP51946 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNHP51946 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms