Protein–RNA interactions for Protein: P51817

PRKX, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKXP51817 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKXP51817 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKXP51817 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKXP51817 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKXP51817 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKXP51817 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKXP51817 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKXP51817 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKXP51817 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKXP51817 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKXP51817 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKXP51817 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKXP51817 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKXP51817 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKXP51817 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKXP51817 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKXP51817 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKXP51817 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKXP51817 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKXP51817 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKXP51817 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKXP51817 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKXP51817 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKXP51817 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKXP51817 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKXP51817 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKXP51817 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKXP51817 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKXP51817 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKXP51817 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKXP51817 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKXP51817 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKXP51817 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKXP51817 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKXP51817 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKXP51817 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKXP51817 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKXP51817 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKXP51817 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKXP51817 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKXP51817 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKXP51817 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKXP51817 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKXP51817 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKXP51817 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKXP51817 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKXP51817 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKXP51817 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKXP51817 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKXP51817 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKXP51817 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKXP51817 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKXP51817 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKXP51817 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKXP51817 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKXP51817 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKXP51817 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKXP51817 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKXP51817 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKXP51817 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKXP51817 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKXP51817 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKXP51817 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKXP51817 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKXP51817 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKXP51817 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKXP51817 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKXP51817 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKXP51817 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKXP51817 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKXP51817 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKXP51817 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKXP51817 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKXP51817 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKXP51817 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKXP51817 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKXP51817 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKXP51817 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKXP51817 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKXP51817 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms