Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP8P40818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP8P40818 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP8P40818 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP8P40818 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP8P40818 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP8P40818 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP8P40818 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP8P40818 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP8P40818 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP8P40818 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP8P40818 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP8P40818 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP8P40818 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP8P40818 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP8P40818 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP8P40818 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP8P40818 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
USP8P40818 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP8P40818 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP8P40818 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP8P40818 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP8P40818 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP8P40818 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP8P40818 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP8P40818 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP8P40818 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP8P40818 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP8P40818 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
USP8P40818 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP8P40818 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP8P40818 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP8P40818 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP8P40818 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP8P40818 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP8P40818 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP8P40818 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP8P40818 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP8P40818 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP8P40818 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP8P40818 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP8P40818 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP8P40818 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP8P40818 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP8P40818 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP8P40818 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP8P40818 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP8P40818 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP8P40818 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP8P40818 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP8P40818 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP8P40818 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP8P40818 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP8P40818 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP8P40818 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP8P40818 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP8P40818 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP8P40818 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP8P40818 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP8P40818 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP8P40818 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP8P40818 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP8P40818 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP8P40818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP8P40818 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP8P40818 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP8P40818 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP8P40818 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP8P40818 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP8P40818 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP8P40818 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP8P40818 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP8P40818 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms