Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHI3L1P36222 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHI3L1P36222 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHI3L1P36222 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHI3L1P36222 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHI3L1P36222 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms