Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRNA3P32297 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNA3P32297 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHRNA3P32297 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA3P32297 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms