Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMB4P28070 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMB4P28070 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSMB4P28070 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSMB4P28070 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB4P28070 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSMB4P28070 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms