Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSMA5P28066 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSMA5P28066 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSMA5P28066 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSMA5P28066 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMA5P28066 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms