Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO1P25800 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO1P25800 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO1P25800 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO1P25800 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMO1P25800 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMO1P25800 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO1P25800 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMO1P25800 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LMO1P25800 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LMO1P25800 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO1P25800 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO1P25800 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMO1P25800 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LMO1P25800 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LMO1P25800 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LMO1P25800 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LMO1P25800 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO1P25800 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO1P25800 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LMO1P25800 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LMO1P25800 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO1P25800 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO1P25800 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO1P25800 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO1P25800 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LMO1P25800 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LMO1P25800 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO1P25800 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO1P25800 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO1P25800 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LMO1P25800 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LMO1P25800 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO1P25800 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO1P25800 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO1P25800 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO1P25800 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LMO1P25800 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LMO1P25800 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMO1P25800 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LMO1P25800 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO1P25800 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO1P25800 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO1P25800 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO1P25800 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO1P25800 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO1P25800 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO1P25800 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO1P25800 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO1P25800 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO1P25800 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO1P25800 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO1P25800 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO1P25800 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO1P25800 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO1P25800 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO1P25800 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO1P25800 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO1P25800 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO1P25800 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO1P25800 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO1P25800 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO1P25800 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO1P25800 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO1P25800 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO1P25800 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO1P25800 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO1P25800 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO1P25800 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO1P25800 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO1P25800 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO1P25800 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO1P25800 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO1P25800 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO1P25800 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO1P25800 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO1P25800 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO1P25800 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMO1P25800 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMO1P25800 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO1P25800 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO1P25800 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms