Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNE1P24864 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCNE1P24864 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNE1P24864 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNE1P24864 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNE1P24864 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms