Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CCNE1P24864 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CCNE1P24864 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CCNE1P24864 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCNE1P24864 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCNE1P24864 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCNE1P24864 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCNE1P24864 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCNE1P24864 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCNE1P24864 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCNE1P24864 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCNE1P24864 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCNE1P24864 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CCNE1P24864 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CCNE1P24864 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CCNE1P24864 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CCNE1P24864 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CCNE1P24864 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCNE1P24864 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCNE1P24864 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCNE1P24864 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCNE1P24864 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCNE1P24864 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNE1P24864 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCNE1P24864 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCNE1P24864 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCNE1P24864 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCNE1P24864 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCNE1P24864 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCNE1P24864 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCNE1P24864 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCNE1P24864 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCNE1P24864 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCNE1P24864 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCNE1P24864 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCNE1P24864 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCNE1P24864 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCNE1P24864 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNE1P24864 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCNE1P24864 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCNE1P24864 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCNE1P24864 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCNE1P24864 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCNE1P24864 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCNE1P24864 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCNE1P24864 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCNE1P24864 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCNE1P24864 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCNE1P24864 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCNE1P24864 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCNE1P24864 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCNE1P24864 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCNE1P24864 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCNE1P24864 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCNE1P24864 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCNE1P24864 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCNE1P24864 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCNE1P24864 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CCNE1P24864 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
CCNE1P24864 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCNE1P24864 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCNE1P24864 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCNE1P24864 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNE1P24864 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNE1P24864 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCNE1P24864 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNE1P24864 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCNE1P24864 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCNE1P24864 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCNE1P24864 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCNE1P24864 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCNE1P24864 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCNE1P24864 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCNE1P24864 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCNE1P24864 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCNE1P24864 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCNE1P24864 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCNE1P24864 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCNE1P24864 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCNE1P24864 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCNE1P24864 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CCNE1P24864 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCNE1P24864 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCNE1P24864 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCNE1P24864 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCNE1P24864 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCNE1P24864 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCNE1P24864 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCNE1P24864 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCNE1P24864 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCNE1P24864 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCNE1P24864 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCNE1P24864 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCNE1P24864 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCNE1P24864 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CCNE1P24864 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CCNE1P24864 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCNE1P24864 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCNE1P24864 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCNE1P24864 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms