Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf88P0DMB2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf88P0DMB2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf88P0DMB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C8orf88P0DMB2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms