Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNB1P01574 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFNB1P01574 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNB1P01574 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
IFNB1P01574 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNB1P01574 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms