Protein–RNA interactions for Protein: P00519

ABL1, Tyrosine-protein kinase ABL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABL1P00519 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABL1P00519 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABL1P00519 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABL1P00519 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABL1P00519 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABL1P00519 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABL1P00519 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABL1P00519 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABL1P00519 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABL1P00519 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABL1P00519 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABL1P00519 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABL1P00519 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABL1P00519 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABL1P00519 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABL1P00519 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABL1P00519 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABL1P00519 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABL1P00519 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABL1P00519 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABL1P00519 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABL1P00519 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABL1P00519 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABL1P00519 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABL1P00519 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABL1P00519 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABL1P00519 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABL1P00519 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABL1P00519 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABL1P00519 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABL1P00519 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABL1P00519 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABL1P00519 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABL1P00519 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABL1P00519 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABL1P00519 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABL1P00519 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABL1P00519 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABL1P00519 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABL1P00519 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABL1P00519 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABL1P00519 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABL1P00519 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABL1P00519 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABL1P00519 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABL1P00519 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABL1P00519 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABL1P00519 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABL1P00519 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABL1P00519 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABL1P00519 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABL1P00519 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABL1P00519 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABL1P00519 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABL1P00519 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABL1P00519 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ABL1P00519 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABL1P00519 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABL1P00519 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABL1P00519 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABL1P00519 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABL1P00519 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABL1P00519 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABL1P00519 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABL1P00519 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABL1P00519 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABL1P00519 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABL1P00519 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABL1P00519 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABL1P00519 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABL1P00519 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABL1P00519 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABL1P00519 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABL1P00519 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABL1P00519 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms